Description du poste

La Faculté de médecine de l'Université de Genève bénéficie d'une dynamique multiculturelle enrichissante à laquelle elle contribue par son rayonnement dans le cadre des mandats qu'elle s'est donnés : l'enseignement, la recherche et son partenariat avec les Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG).

Afin de renforcer son équipe, la plateforme de bioinformatique de la Faculté de médecine de l'Université de Genève recherche un-e :

Bioinformaticien-ne senior-e et responsable opérationnel à 100% 

(Informaticien-ne de développement 3)

Le/la titulaire du poste aura pour mission de co-diriger, avec le responsable technique, une plateforme bioinformatique destinée à soutenir les chercheurs biomédicaux dans leurs projets. Ceci comprend les tâches suivantes: 

- diriger les opérations de la plateforme, y compris la programmation et le calcul des coûts du travail

- communiquer avec les chercheurs sur leur problématique d'analyse des données et leur apporter des solutions techniques

- identifier les possibilités de formation en science des données pour les scientifiques travaillant en laboratoire

- diffuser les résultats de la plateforme 

- maintenir une excellente communication avec des chercheurs d'autres groupes de l'Université ou des HUG pour assurer une communauté scientifique dynamique concernant les données de santé et biomédicales. 

Titre et compétences exigés

• Doctorat en sciences biomédicales, sciences informatiques, mathématiques, physique ou ingénierie ou dans un domaine équivalent.
• Minimum 3 années d'expérience dans un rôle de bioinformaticien ou d'informaticien appliqué à un contexte biologique ou biomédical.
• Excellentes compétences en programmation (notamment en R) et maîtrise des systèmes d'exploitation Linux/Unix.
• Maîtrise des technologies de séquençage haut débit.
• Bonne connaissance du langage des chercheurs en neuroscience, microbiologie, génétique, immunologie afin de communiquer avec eux.
• Excellentes compétences en gestion de données qui garantissent que votre travail est sûr, reproductible et ouvert.
• Expérience des logiciels de gestion de conteneurs tels que Singularity et Docker et des logiciels de gestion de pipeline tels que Snakemake ou Nextflow pour améliorer la reproductibilité est souhaitable mais pas essentielle.
• Expérience en gestion d'équipe et en coordination de projets multidisciplinaires.
• Maîtrise de l'anglais (essentielle).

Le/la titulaire du poste devra faire preuve d'enthousiasme pour une approche collaborative et interdisciplinaire, avoir un goût prononcé pour le partage des résultats en open source et d'excellentes capacités en communication et pédagogie.

Entrée en fonction

01.02.2025 (ou à convenir)

Contact

Si vous êtes passioné par la bio-informatique dans un contexte médical, l'enseignement, la formation des scientifiques en laboratoire, et si vous correspondez à la description ci-dessus, nous serions très heureux de recevoir votre dossier de candidature (Lettre de motivation, CV, certificats, diplômes) qui devra être déposé exclusivement en ligne en cliquant sur le bouton cidessous "Postuler/Apply now".

Pour toute question ou discussion informelle concernant ce poste, veuillez contacter Timothy Frayling à l'adresse suivante : Écrire un email

Informations complémentaires

Contrat à durée indéterminée de droit privé

Job description

The Faculty of Medicine at the University of Geneva benefits from a rich multicultural environment to which it contributes in the framework of its core mandates: teaching, research, and its partnership with the Geneva University Hospitals (HUG).

To strengthen its team, the Bioinformatics Platform of the Faculty of Medicine at the University of Geneva is seeking a:

Senior Bioinformatician and Operational Manager (100%)
(Development Engineer 3)

The incumbent will be responsible for co-leading, alongside the technical manager, a bioinformatics platform dedicated to supporting biomedical researchers in their projects. This includes the following tasks:

• Managing the platform's operations, including programming and workload cost estimation

• Communicating with researchers about their data analysis challenges and providing them with technical solutions

• Identifying training opportunities in data science for laboratory scientists

• Disseminating the platform's results

• Maintaining excellent communication with researchers from other university or hospital groups to foster a dynamic scientific community around health and biomedical data.

Required Qualifications and Skills:

• PhD in biomedical sciences, computer science, mathematics, physics, engineering, or an equivalent field.

• At least 3 years of experience in a role as a bioinformatician or applied computer scientist in a biological or biomedical context.

• Excellent programming skills (notably in R) and proficiency in Linux/Unix operating systems.

• Expertise in high-throughput sequencing technologies.

• Good knowledge of the language used by researchers in neuroscience, microbiology, genetics, and immunology to facilitate communication.

• Strong data management skills ensuring that your work is secure, reproducible, and open.

• Experience with container management software such as Singularity and Docker, as well as pipeline management software like Snakemake or Nextflow to enhance reproducibility, is desirable but not essential.

• Experience in team management and coordination of multidisciplinary projects.

• Proficiency in English (essential).

Contact

If you are passionate about bioinformatics in a medical context, teaching, training laboratory scientists, and if you meet the criteria outlined above, we would be very pleased to receive your application (cover letter, CV, certificates, diplomas), which must be submitted exclusively online by clicking on the "Postuler/Apply now" button below.

For any questions or informal discussions regarding this position, please contact Timothy Frayling at the following email address: Écrire un email

Additional information

Permanent contract under private law

L'Université de Genève offre des conditions d'engagement motivantes dans un cadre de travail stimulant. En nous rejoignant, vous aurez l'occasion de mettre en valeur vos compétences ainsi que votre personnalité et contribuer activement au rayonnement d'une Institution fondée en 1559.

Dans une perspective de parité, l'Université encourage les candidatures du sexe sous-représenté.