Depuis la fusion, de nombreux processus ont été compliqués et, dans le même temps, des postes importants au sein de l'administration et/ou de l'état-major n'ont pas été repourvus de manière satisfaisante.
Les spécificités des différents départements sont mises dans le même panier - bien que l'environnement du marché soit diamétralement opposé pour la technique et la santé.
L'ambiance des collaborateurs est mauvaise, car l'OST n'a rien appris des processus de fusion des autres hautes écoles. Les chercheurs deviennent des dirigeants sans avoir la moindre idée de la direction et du management, et encore moins de la communication.
La compensation du renchérissement de 1,4% a été célébrée par le chef d'état-major suprême comme une "augmentation de salaire", les avis d'experts (et nous en avons beaucoup, nous sommes une haute école et nous formons du futur personnel spécialisé !) ne sont ni consultés ni valorisés.